警备司令部其实就是宪兵司令部，是在驻军较集中的城市设立的担任军容风纪、军车检查等任务的机构。同时还是驻地军事工作部门和市政府的兵役工作机构，受军区和当地市委、市政府的双重领导，协助警备部队，领导区、县人民武装部，负责所在城市的警卫、守备和民兵、兵役、动员工作。据《解放军报》报道，九十年代初，在全国设立了200多个警备司令部。警备区属军区建制。设有司令部、政治部、后勤部等领导机关。警备区大于军分区，军分区大于警备司令部。

　　警备司令部的司令一般并不是该省级军区或军分区的司令来担任，而是由该单位的副司令来担任的，参谋长也是由本单位的副参谋长来担任。因为是省会，自治区首府城市，沿海重要城市，驻军相对集中的城市才会设立警备区（设立警备区的城市政府级别至少地市以上，即设区的城市）所以一般是正师级别。而除了二位领导外，警备司令部就再也没有其它首长了，接下来的就是日常办公机构（即军务处、科或军务动员处、科内设置的警备办公室），再下来就是编制的专职或临时兼职的警备纠察连（排）。

　　警备分队执行日常检查纠察勤务，由警备司令部按照计划派遣。动用警备分队和装备执行与警备勤务无关的任务，或者动用警备分队以外的部队(分队)执行警备勤务，必须按照中央军委关于部队部署和调动的批准权限执行。