齐鲁晚报·齐鲁壹点记者王小蒙 通讯员 王晓婷 赵怀龙 实习生 陈文静

　　近日，济南市疾控中心成功完成1份进口冷链物品涂抹物新型冠状病毒弱阳性样本全基因组测序工作。通过对测序结果进行生物信息学分析，显示该样本的病毒株序列属于G clade（B.1,20A）分支，与我国既往已报道的输入性病例的新冠病毒不存在关联性。由具体突变位点和进化关系来看，不属于目前海外流行的英国、巴西、南非等新变异株或其近源株。

　　通过在全球公开数据库比对发现，该毒株的基因组序列与WuHan-Hu-1(NM908947)相比，存在14个突变位点。同源性分析显示，该病毒株基因组序列与Pakistan/NIBD-04-KHI/2020（巴基斯坦）和Bermuda/204990924/2020（百慕大）高度同源，其中NIBD-04-KHI序列源于巴基斯坦2020年10月份感染病人，204990924序列源于百慕大2020年11月份感染病人。结合冷链物品的流行病学分析，提示该批次产品在巴基斯坦污染的可能性极大。

　　高通量测序技术在发现新病原、识别已知病原及鉴定未知病原等方面发挥关键作用。本次测序工作由中心实验室联手华大智造，采用华大智造测序试剂与高通量测序仪进行测序分析，克服了弱阳性样本低病毒载量时难以获得全基因组序列的困难。测序结果显示，单个样本的新冠病毒序列数至少达到4M条，测序深度平均10000×以上，有效实现了对新冠病毒的高精准溯源，保证了溯源结果的完整性和及时性，标志着我中心基因测序能力的提升，也是我中心与华大战略合作的又一成果。