众人期盼新冠病毒的疫苗，如大旱之望云霓。然而，病毒在人体内快速的变异，又为疫苗的开发蒙上了一层阴影。

　　大部分的变异体是因为随机发生的错误而意外出现的，是一种 “不在计划内的生育”。遗传总归是有迹可循，找到其娘亲，对跟踪病毒源头还是挺有用的。但这种变异并没有功能上的实质性改造，不过是新瓶装旧酒而已。于诊断、疫苗开发、药物筛选和抗体研制等方面用处不大，却让问题复杂化。

　　新冠病毒在传播中突变

　　但新冠病毒和大多数其他RNA病毒相比，有一个与众不同的特点，它所表达的3 '-到-5 '核糖核酸外切酶，能使相对较大的26-32kb基因组得以高保真复制，维持了基因的稳定性。澳大利亚国家科学机构CSIRO的研究人员抓住了新冠病毒的这个小辫子，利用基因组学和生物信息学手段，新创了一种分析新冠病毒遗传密码的办法，并将其用于疫苗开发的毒株筛选。

　　变异让病毒性情大变

　　这篇最近发表在《Transboundary and Emerging Diseases》的文章，以《Supporting pandemic response using genomics and bioinformatics: a case study on the emergent SARS-CoV-2 outbreak》为题，试图在纷纷扰扰的众多变异体中，拨云见日，找出最具代表性的菌株用于动物模型和临床前研究。

　　研究人员开发了一种新颖的可视化平台，以生物信息学算法为基础，用来识别新冠病毒数千个基因序列之间的差异。团队已经分析了全球疫情爆发以来发表的前181条病毒序列，并据此建立了系统发育树，用以了解变异是如何让病毒性情大变的。

　　论文的第一作者鲍尔博士说：“我们对遗传差异及其对疾病进展的可能后果了解得越多，我们越能通过诊断和治疗方法更好地应对疾病。”

　　系统测序显示，许多分离株的核心基因组都有缺失，并可能对病毒结构或功能的影响产生显著影响。例如，澳大利亚/VIC01和悉尼/2可能干扰了IBV motif的复制，而美国/CA6和日本/AI-004可能干扰了非结构蛋白1 (nsp1)，影响了宿主基因表达。

　　另外，病毒系统发育树显示新冠病毒存在三大突变集群(C1-C3)，可能还会出现另外三个集群(C4-6)。目前的动物模型(绿色部分)覆盖了主要的集群(C1-3)，但可能没有涵盖新兴的集群。

　　适合动物模型的潜在病毒株。成熟(橙色)和新兴(黄色)。

　　英国约克大学名誉教授瓦桑（Vasan）教授则认为：新冠病毒将进化成许多具有相同突变的独特簇。监测很重要，能让研究人员洞悉不同毒株的前世今生以及将来进化的目标。但目前病毒突变并没有对疫苗开发、疾病诊治造成大的影响。

　　这个办法已经派上了用场，帮助位于吉朗的澳洲疾病预防中心，找到了适合的疫苗开发病毒株。

　　结语

　　无论病毒如何变，对它变异体的了解越多，疫苗开发更有利。疫情仍未结束，将来卷土重来未可知。即使大流行疫情突然结束，我们也应该继续开发最有希望的候选疫苗。

　　面对狡猾的敌人，有一种战术叫：以不变应万变。