原生生物基因组计划启动!我国将建原生生物遗传资源数据库

原生生物基因组计划启动!我国将建原生生物遗传资源数据库
2020年01月09日 09:23 新浪网 作者 中国医院院长杂志社

      原生动物是生命的五大王国之一(植物王国、真菌王国、动物王国、原生动物王国和莫内拉王国)。它主要是由单细胞真核生物组成的一大群,包括单细胞真核藻类和原生动物等。已经描述了60,000多个物种,未知物种难以估计。

近日,全球首个“万种原生生物基因组计划”在武汉启动。该项目由中国科学院水生生物研究所联合西藏大学、河南农业大学、中国农业科学院兰州兽医研究所、中国科学院北京基因组研究所和华中科技大学等单位共同发起。计划在3年内,绘制万种代表性原生生物基因组图谱,建立一个大规模的原生生物遗传资源数据库。

据报道,原生动物分布非常广泛。只要有水,就会有原生动物。原生动物是水生生态系统的重要组成部分,藻类占地球光合行为的近50%,也是水生动物和人类的优良食物和营养。此外,一些甲藻和硅藻的过度生长将导致河流和海洋中有毒藻类大量繁殖,带来严重的环境问题。同时,许多原生动物是人类、家畜、家禽和水生动物的重要病原寄生虫,如疟原虫、锥虫、球虫和葫芦,它们会引起人类疟疾、昏睡病、鸡球虫病等。

据了解,至少有28种原生动物是人体寄生虫,危害人体健康,全世界至少有四分之一人口患寄生虫病。在我国重点防治的有五大寄生虫病:血吸虫病、疟疾、黑热病、丝虫病、钩虫病,其中疟疾和黑热病就是分别由疟原虫和利什曼原虫引起的。另外,还有锥虫引起睡眠病、毛滴虫病、阿米巴痢疾等都是危害较重的人体寄生虫病。焦虫、球虫等危害家畜,黏孢子虫、小瓜虫、车轮虫等危害鱼类。

据悉,该计划将依托各发起单位保藏的3000多种株真核藻类和原生动物的种质资源,通过持续的样品采集和宏基因组数据挖掘,在未来3年(2020年—2022年)完成约一万种原生生物的基因组测序和分析,将包括原生生物全部26个门/类,覆盖超过85%的纲、60%的目和30%的科属。

据了解,该计划将以开放联盟模式运行,国内外有兴趣研究团队均可加入。开展万种原生生物基因组计划,对理解生物多样性形成机制、多细胞生物/有性生殖的起源与演化等重大基础生命科学问题,推动与生态环境保护、营养健康和疾病防治相关原生生物种质遗传资源的挖掘与应用实践具有重要意义。

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