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坐标北京,第六届R语言数据分析与可视化编程培训班(快速入门)

坐标北京,第六届R语言数据分析与可视化编程培训班(快速入门)
2020年10月30日 07:31 新浪网 作者 brainnews脑科学新闻

  北京赛博尔医药科技有限公司将联合brainnews于2020年 12月11日 至 2020年12月13日(周五至周日)举办第六届R语言数据分析与可视化编程快速入门培训班(课程内容详见课表安排)。欢迎大家前来咨询及报名参加!

   此次培训班依然坚持小班教学,手把手带教的教学模式,此次培训限定人数25人左右,报名敬请从速,争取使每一位参加培训的学员能够在数据分析方法上取得进步。

  

  培训简介

  R语言带来了数据分析领域新的革命!因其具有强大高效的数据分析能力和自由美观的可视化绘图效果,在数理统计、互联网、人工智能、金融、生物医学、天文地理、物理化学等各个领域脱颖而出,尤其在国际上广泛受到研究生、一线科技人员、临床医生和学者的青睐。R语言因其简洁易懂、免费开源,本着资源共享和共同提高的原则,截至2020年8月,R官方在线资源库已有远超16000个免费开源的R工具包及其源码,另外在开源托管平台Github上已有约32000个R包及其源代码公开,拥有无数的在线帮助资源和活跃人员。

      掌握R语言不仅可以提高复杂数据分析效率、绘制各类漂亮图表,促进发表高质量国际学术论文,而且还可以在他人工具和源码基础上修改完善,设计并发布自己的数据分析工具,提高自己在相关领域的国内外知名度。因此,及时掌握R语言,不仅是一项基本功,更是站在巨人肩膀上实现科研创新的得力助手。

  本培训班将通过为期仅三天但内容核心且丰富的讲解及训练,使学员能够快速入门R语言,具备独立开展数据基本处理、统计分析和可视化的能力,为后期自主使用R语言开展自由编程、模型研究、工具设计等高级应用奠定坚实基础。

                图 1 基于R语言的生物医学数据可视化示意图(非入门内容)

  

  培训对象和目的

  本次培训班面向的对象是各单位从事数据处理、时序分析、图像图形处理分析、可视化交互处理分析等领域相关的企事业单位技术骨干、科研院所研究人员和在校研究生等相关人员,以及数据分析和可视化的广大爱好者。

  NO.1培训班为以下人员量身定制:

  ●R语言零基础或入门级,但渴望能够快速get新技能的青年人员;

  ● 期望开展创新性、创造性工作的,从事科研和临床研究的医生、研究生、青年科技骨干等;

  ●从事模型研究的数据分析人员,从事诊断分析的图形图像可视化分析人员;

  ●对重复性实验、成果绘图等要求较高的、有国际学术论文发表需求的人员,等。

  NO.2培训班的目的是使学员能够:

  ●熟悉R和Rstudio软件以及R包的使用技巧;

  ●掌握R语言的数据类型、对象操作和编程技巧;

  ●掌握R语言基本的数据处理、建模分析和图形图像可视化方法和绘图技巧;

  ●了解fMRI、DTI、EEG等相关R 包,掌握相关未知R包、最新R包的快速检索和获取的技巧。

  

  设计自己心中的分析工具or依赖已集成好的工具/GUI?

  对于从事数据分析和可视化的研究人员来讲,最至关重要的莫过于能够“亲近”自己的数据、分析其特定规律并完美展示其各项特性。虽然在前期部分科研人员的努力下已经设计开发完成了一些高度集成好的数据分析工具(图形用户界面GUI),对于数据分析新手来讲可按照流程通过一步步点击鼠标即可完成数据的导入、处理、分析、可视化和导出等,操作简便,然而,开展数据分析的科研人员必须要设计自己的数据分析流程、方法、模型、可视化效果、结果形式等,对于这些创新性研究,已高度集成的工具/GUI或许反而成为一种障碍。因此,利用R开放共享的工具包和软件代码,使用者可以Inspect your data and check your model at every step,设计和开发满足自己需求的工具包或者程序,开展创新性的数据分析研究工作。

  

  为什么要掌握新技能R语言

  "The nice thing about standards is that you have so many to choose from." — Andrew S. Tanenbaum.

  现在已经有可以使用的数据处理、分析和可视化的相关工具和编程语言,为什么还要学习一门新的数据分析语言R?

  no.1    R语言软件、包、程序和文档等全部free、opensource

  很重要的一方面,R是免费的R相关软件和工具等可以从官方网站任意地下载安装和免费使用,新版本还能免费自动更新,各种程序代码和文档也都可以随意免费下载和使用,代码和文档有新修订时也可免费自动更新。更重要的一方面,R是开源的,所有数据处理、分析和可视化的工具以及程序,源代码都是公开的,所以用户可以在别人基础上修改代码、添加功能、完善工具等。并且,用户还可以设计开发自己的工具包。

  no.2     R语言强大的数据分析能力和团队支撑

      统计科学家发明了R语言,并且R语言软件设计开发的核心成员也主要是统计学家。除了统计学科的人员使用R语言外,很多涉及数据分析(如金融、工程、生物、医学等)领域的工程和科研人员也都广泛使用R语言开展研究工作。截至20208月,R官方网站CRAN知识库里已经远超过16000个R工具包(Packages)及其源代码,Github上也有约32000个R包及其源代码,由各行各业的科研人员在不断地进行补充、维护和更新。对于每个领域甚至每个R工具包,都有相应的博客、论坛、开发人员等提供及时和专业的解答,促进大家共同维护和完善相关的代码和工具包。

  no.3    R包的使用和管理so easy

  R对于工具包的管理非常完善,一方面,R工具包的存储和管理全部在云端,用户不必在互联网苦苦搜寻想要的工具包,在R软件中即可一键检索、下载和更新,还会有相关推荐。另一方面,下载和安装用户感兴趣的R工具包时,该工具包依赖的其它所有工具包(包括代码和文档)都会自动地下载和安装,直至该用户感兴趣的工具包可直接使用,而无需用户费尽周折不断去下载和安装相关工具。

  no.4    R语言可直接生成报告文档

  使用R自带的工具包(如Knitr)可以按照默认或指定格式(如LATEX)编写数据分析报告、使用说明文档、学术论文、学位论文等。支持边数据分析、边一键生成相关报告,报告可囊括文本说明、程序代码和相应结果、数据内容、公式图形图表、数据分析结果、甚至交互式动态分析等,报告文档布局精致、格式统一、数据详细、图表精美,是编写实验报告、学术论文等的得力助手。

  no.5    R语言方便开展重复性实验、创新性尝试

  随着科学研究的国际化和开放共享,科研成果的发表除了公开研究方法外,还伴随着原始数据、方法参量参数、程序代码、中间数据和结果数据的公开,以便于学术界通过重复性实验得以验证。当前越来越多的科研人员通过R语言进行数据处理、分析和结果可视化,不断地公开着相关的研究数据、R工具包、R程序代码和使用手册。使用者可直接利用相关文档和数据,基于前沿研究公开的R工具包和程序代码,开展重复性实验,同时通过修改和完善相应程序代码进行创新性研究尝试,形成并发表自己更前沿的研究成果。

  

  一些R语言数据分析和可视化示意图

                    图 2 基于R语言的fMRI脑网络分析示意图(非入门内容)
 3 基于R语言的顶点组分析广义线性模型GLM分析示意图
 4 基于R语言的多阈值置换矫正MTPC分析示意图
 5 基于R语言的Bootstrap 分析和多变量分布分析示意图
                        图 6 基于R语言的组分析箱线图和直方图示意图
 7 区域贡献和个体贡献(留一法)分析示意图
                        图 8 基于R语言的脑图邻接矩阵组分析示意图
                            图 9 基于R语言的密度测度多元分析示意图
                        图 10 基于R语言的皮质厚度组分析示意图
 11 利用R语言自主设计开发脑图网络分析工具示意图(非入门内容)

  

  课程安排

  时间

  课程安排

  主要内容

  第一天

  上午

  R软件+R包+R编程快速上手

  R的过去现在与未来,R及RStudio软件的配置和便捷使用技巧;

  如何站在巨人肩膀上高效利用R在线知识库(综合档案网络CRAN、R包、Github等);

  R包快速检索、自动下载、安装和加载;

  R编程结构全掌握(对象、函数、程序等);

  R编程语法全掌握(赋值、调用、参数、命令等);

  下午

  R语言数据文件交互快速上手

  文本和表格文件交互,txt、csv、xls等;

  图像文件交互,tif、dicom、nifti等

  与Matlab交互,读写.mat文件;

  R语言基础数据操作快速入门

  基础数据结构(标量、向量、数组、矩阵等);

  基础数据操作(提取、删除、查找、替换、合并等);

  基础数据运算(数学运算、向量运算、矩阵运算等);

  晚上

  课外自由练习和在线答疑

  熟练利用RStudio进行数据基本操作和处理,熟悉相关R语言函数的调用;

  第二天

  上午

  R语言高级数据操作快速入门

  高级数据结构(数据框、列表、时间序列等);

  高级数据操作和运算(数据抽取、拆分、合并、批量替换等);

  高级数据处理(类型转换、缺失值处理、字符串操作、多维变换等);

  R语言基本数据可视化快速入门

  数据的基本可视化(散点图、直方图、柱状/条形图、箱线图、热力图、相关图等);

  时间序列和图像的可视化;

  绘图元素的添加和布局,子图绘制及画板布局技巧;

  R语言自动保存高质量绘图结果为pdf、eps、jpg、png等;

  下午

  R语言高级统计可视化快速入门

  高级可视化R包ggplot2简介;

  几何要素、统计要素、坐标、图层等;

  多因素作图、统计作图、置信区间等;

  自由美化;

  晚上

  课外自由练习和在线答疑

  熟悉数据分析与可视化相关R函数;

  第三天

  上午

  R语言

  统计分析快速入门

  统计分析基础(概率分布检验、方差分析、相关分析、回归分析等);

  时序数据建模与预测;

  · 回归分析模型(线性模型、多项式模型、非线性模型等);

  下午

  R语言

  高级编程简介和自定义程序设计入门

  自定义函数(传参和对象返回,局部/全局变量等),自定义程序,函数/程序的引用和调用;

  R语言高效运算编程技巧(向量运算,行/列运算,批处理等);

  医学数据处理R包相关技巧

  · fMRI、PET、DTI、EEG等数据处理、分析与可视化R包简介及如何上手;

  · 学科相关未知/感兴趣R包快速检索技巧;

  现场答疑和指导

  课程相关内容的答疑,自有数据分析与可视化实践的现场指导;

  课程外学员感兴趣方法、模型和绘图技巧的交流;

  结课后

  7*24h

  在线答疑、自有数据分析指导、新资料分享等

  答疑R语言数据处理、分析和可视化相关问题;

  指导学员解决自有数据分析和可视化中的困难;

  分享新学习资料(新技巧、新R包等)。

  

  学员携带电脑要求

  请各位培训学员自带笔记本电脑,有数据的可以带1-3例进行现场处理。

   硬件需求:硬盘30GB以上可用存储空间,内存4GB及以上,CPU i5及以上,无线网卡,集成/独立显卡;

  ●系统需求:Window/MAC/Linux均可,Windows Vista/7/8/10 32/64位系统,或MAC OS X及以上系统,或Linux debian/redhat/suse/ubuntu系统;

  ●软件需求:学员可提前至R官方网站(https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/)下载相应操作系统的R语言软件,然后至R-Studio官方网站(https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/)下载相应版本的R集成开发环境软件RStudio。可默认安装。

  

  培训老师简介

  周老师,中科院博士、副研究员,信号与信息处理专业,数字图像处理和大数据分析方向;长期从事时间序列分析、数字图像处理、异常检测分析等方面的研究工作,承担国家自然科学基金、国家863课题、国防科技创新、国际合作项目等国家级项目近10项;具有丰富的R语言数据处理、分析和可视化等算法和程序设计经验,在领域知名IEEE期刊和会议上以第一作者发表论文二十余篇,授权发明专利5项,领域多个国际期刊的审稿人;已指导多名研究生。

  

  培训地点及费用

  为保证培训质量,此次培训限定人数25人左右,报名敬请从速。

  地点:北京5L酒店(暂定,具体地点会在开班前一周会详细通知大家)

  主办方:北京赛博尔医药科技有限公司

  所有参会人员2000/人(含资料费、培训费和午餐费;交通及住宿费自理)。

  注:请学员们在12月9日前进行缴费及将回执表发到brainnews@163.com,便于培训安排。

  

  报名及缴费方式

  请将报名回执发送至:brainnews@163.com

  张老师18991188049(同微信)  

  银行转账或者支付宝(账号:13381109780 户名:杨南),不接受现场缴费,谢绝录像,协办方提供发票。

  报名回执表

  单位名称

  (发票抬头,纳税人识别号)

  姓名

  性别

QQ

  电话号码

  科室/专业

  缴费方式

  □转账   □微信 □支付宝 (请选择在□打√)

  银行信息

  户名:北京赛博尔医药科技有限公司

  账号:631772209

  开户银行:民生银行北京正义路支行

  汇款备注

  第六届R语言数据分析与可视化培训班

  注:请完整填写回执表后回传给我们,以便给你发送确认函,谢谢支持!

  十一

  在线支持服务

  参加培训学员将得到授课老师及公司技术人员的长期在线技术支持服务,伴随参加培训班的学员共同成长。

  培训相关文件及报名回执单下载链接:

  链接:https://pan.baidu.com/s/100D9donzSRnZJIlB211z8g

  提取码:d2o1

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