拿破仑入侵整个伊比利亚半岛，标志着葡萄牙和西班牙被彻底占领。成为拿破仑帝国的一部分。虽然战争结果是拿破仑实际控制了两国，但遭受的损失也颇为可观。葡萄牙倒还简单，西班牙却爆发出乎想象意料之外的激烈反抗。这场战争使拿破仑的部队遭受了相当大的损失。而且影响了之后拿破仑征服其它国家的设想。

　　拿破仑想吞并伊比利亚半岛其实正是时候，西班牙已经衰落的不成样子。西班牙本土没有富庶的土地和工业，海外殖民地赚来的钱也无法撑起西班牙的经济。西班牙王室是已经垮台的法国波旁王朝的亲戚。当政的卡洛斯四世国王智商低下，不是形容，而是真的智商不行。而且和腐败王朝一样，有个奸臣首相戈多伊乱政，这是卡洛斯四世的王后帮他挑选的首相。拿破仑此时野心颇大，除了法国本土，比利时、德国、意大利都纳入其统治版图。

　　于是吞并西班牙成为拿破仑的一个执行计划。他先拉拢西班牙瓜分葡萄牙，西班牙同意了。拿破仑此举很像东周借道灭国那一出戏。入侵葡萄牙十分成功。战事草草结，拿破仑接着正式开始了征服西班牙的作战。拿破仑先拥计挑起西班牙王室内讧，随后增兵18万占领了西班牙北部。混乱之后，拿破仑逼西班牙国王禅位，随后把自己兄长约瑟夫立为西班牙国王。此时大功告成，西班牙正式被吞并。但是西班牙各地马上爆发人民起义，随后起义规模越闹越大，拿破仑为了应付西班牙的起义，陆续增兵30万人，西班牙人的反抗异常激烈。法国虽然接连取胜，却换来了西班牙人转用游击战。拿破仑的军队被牵制在伊比利亚半岛。从1808年战争开始到1813年撤出，拿破仑在伊比利亚半岛损失了24万人，大半死在了游击战中。