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mRNA疫苗稳定性不够?百度AI算法LinearDesign给出最优解

mRNA疫苗稳定性不够?百度AI算法LinearDesign给出最优解
2020年05月15日 14:01 新浪网 作者 推哥谈科技

  每天质问老天一千遍,我的快乐会回来么?一场疫情让曾经稀疏平常的生活变得模糊陌生,究竟什么时候才能摘下口罩肆意吃喝、浪迹各种演唱会、狂刷NBA赛事?新冠疫情全球蔓延仍在持续,此时此刻,再没有比成功研制出新冠疫苗、药物更为紧迫的事情了。

  mRNA疫苗稳定性不够?百度AI算法LinearDesign给出最优解

  在所有正在研发的疫苗中,mRNA疫苗是极具潜力的“尖子生”。mRNA疫苗却又很“脆弱”,在保存、运输过程中可能因为降解而失效。研究表明,当mRNA序列的二级结构越多就越稳固,制成的mRNA疫苗更稳定、效果更好。不过,要从10的632次方(脑细胞选择性死亡)个mRNA序列中甄选出最稳固的序列,简直是史诗级“太南了”。

  mRNA疫苗稳定性不够?百度AI算法LinearDesign给出最优解

  现在,“拯救世界”的新算法来了!百度研究院重磅推出全球首个mRNA疫苗基因序列设计算法LinearDesign,是专门用于优化mRNA序列设计的高效算法。针对新冠mRNA疫苗序列,LinearDesign能在16分钟内大大提升疫苗设计的稳定性和蛋白质表达水平,有效解决了mRNA疫苗研发中最重要的稳定性问题。借助AI算法的力量,疫苗研发将自带Buff,提档加速不要太轻松。

  mRNA疫苗稳定性不够?百度AI算法LinearDesign给出最优解

  为什么mRNA疫苗如此受偏爱呢?不妨先补补课,回顾一下疫苗的基本原理。

  众所周知,疫苗能够调动身体的免疫系统,识别并消灭病毒、细菌等病原体以及其他相关的微生物体,从而达到免疫的效果。疫苗研制包含多种路径,如DNA疫苗、mRNA疫苗、蛋白质疫苗等,各有优缺点。

  其中,蛋白质疫苗是经过体外培养病毒后,制成减活或灭活的疫苗。由于需要体外培育,蛋白质疫苗成本更高,也十分耗时。与疫魔生死竞速之际,病毒突变如此迅速又无法预测,疫苗研制周期长就成了不可忽视的劣势。

  DNA疫苗含有DNA序列,能够编译对抗病毒的蛋白质,进而激活人体免疫系统。DNA疫苗技术起步较早,技术也较为成熟。但由于不容易降解,DNA会长期存在体内,存在与人体融合方面的安全隐患。

  mRNA疫苗通过在体外合成翻译抗原的mRNA,然后注射到体内,再由体内的细胞翻译成抗原蛋白质,达到免疫效果。对比蛋白质疫苗,mRNA疫苗具有制备快、成本低等优点,也避免了DNA疫苗的融合问题。同时,mRNA疫苗还能够同时注射多个疫苗毒株,适合病毒不断变异的情况。据悉,美国生物技术公司Moderna已经开始评估COVID-19 mRNA疫苗效果的人体实验,并且已经在五月初开始二阶段的测试。

  尽管优势明显,mRNA疫苗也有天然的缺陷。在保存、运输等过程中,mRNA疫苗可能因为稳定性不足导致降解而失效。再者,mRNA疫苗是通过在体内由mRNA翻译生成抗原蛋白质,蛋白质表达水平(合成多少蛋白质)直接影响到最终的免疫效果。近期研究表明,mRNA的二级结构对其稳定性和蛋白质表达效率等方面都发挥着重要意义,具有稳定二级结构的mRNA序列,其制成的mRNA疫苗稳定性高,效果更好。

  mRNA疫苗稳定性不够?百度AI算法LinearDesign给出最优解

  怎样才能选择更稳定、表达水平更高的mRNA序列呢?有请LinearDesign算法作答。

  要知道,新冠病毒刺突蛋白(抗原)共有1273个氨基酸,能翻译成刺突蛋白的mRNA序列高达10的632次方。这个数字是什么概念呢?假设有个超级计算机一秒可以计算一个mRNA序列的二级结构,那么即使从宇宙形成开始算到现在(约130-140亿年),可能连mRNA序列所有可能的亿万分之一都没算完。实在太南了吧!

  面对这一“世界性”难题,人工智能表示小意思。LinearDesign算法应用计算机科学领域经典算法——动态规划算法,将这一问题的搜索时间从亿万亿年降低到分钟级。在新冠病毒的刺突蛋白序列上的实验表明,LinearDesign能够设计出结构最稳定的序列,而且设计时间只需要1个半小时。如果采用线性时间近似算法,所需时间可以进一步缩短到16分钟。

  mRNA疫苗稳定性不够?百度AI算法LinearDesign给出最优解

  简单说,LinearDesign算法是专门用于优化mRNA序列设计的高效算法,相当于直接跳过“海选”阶段,靶向出击,精确实验,pick出效果更好的疫苗序列。LinearDesign算法如此给力,将颠覆性助推mRNA疫苗研发刷新速度,为拯救全人类争取更多时间!

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