第23届全国肿瘤大会暨2020年CSCO学术年会于9月19日正式拉开了“CSCO年会学术周”的帷幕。今天(9月22日)下午,在CSCO妇科肿瘤专委会主任委员、中国医学科学院肿瘤医院吴令英教授的主持下,妇科肿瘤专场圆满召开。
梁晗 教授
美国排名第一的德州大学MD安德森癌症中心生物信息学与计算生物学系正教授,副系主任;
美国癌症基因组图谱计划 (The Cancer Genome Atlas) (TCGA)泛癌症临床和预测科学组主席;
国际癌症基因组 (International Cancer Genome Consortium) 泛癌种全基因组计划共同领导者;
美国国家癌症研究所基因组数据库 (Genomic Data Commons)质控和分析组共同主席;
美国,欧盟,英国,以色列,日本,中国癌症基金项目评审专家;
过去6年,作为主要通讯作者,在Cell, Cancer Cell,Nature Biotechnology, Nature Methods, Nature Genetics, Nature Metabolism 等顶级学术期刊发表癌症基因组学和肿瘤精准治疗相关的论文十篇,所有学术文章累积IF>1800;
自2012来,科研工作受到美国主流媒体如《华尔街日报》和《新闻周刊 》关注和中国中央电台采访。
在过去的10年里,癌症组学数据迅速积累,与此同时,以深度学习为代表的人工智能技术也快速发展,为理解和应用数据提供了工具,数据驱动的癌症转化医学时代已经到来。 抗癌管家-康爱管家,我们一起抗癌,治愈癌症不是梦。普瑞基准科技联合创始人、MD安德森癌症中心生物信息学与计算生物学系副系主任梁晗教授,受邀进行了题为《妇科肿瘤组学大数据挖掘》的精彩演讲,深入阐述了如何通过多组学数据的深度挖掘,为妇科肿瘤临床治疗研究提供新思路、新方法。
TCGA癌症多组学大数据挖掘子宫内膜癌分子分型研究
The Cancer Genome Atlas(TCGA)是一个里程碑式的肿瘤多组学研究项目,通过对涵盖33种癌症超过11000名病人的全方位信息采集和全景式组学描述,形成了一个非常丰富而宝贵的知识库。梁晗教授是美国癌症基因组图谱计划(TCGA)泛癌症临床和预测科学组主席,近年来以TCGA多组学数据为核心,进行一系列的泛癌种大数据深度挖掘与分析,发表了一系列高水平文章,研究各种癌症的共性和区别,从而更为深入地了解癌症的分子机制。
梁晗教授通过对近400例子宫内膜癌患者TCGA数据的分析,用多重组学数据进行异质化描述,不仅发现了驱动基因,更是第一次使用多重组学数据对一个癌种进行分子分型,并于2013年发表在Nature上。 抗癌管家-康爱管家,我们一起抗癌,治愈癌症不是梦。此研究通过多组学数据挖掘,将子宫内膜癌分为POLE超突变型、微卫星不稳定超突变型(MSI-H)、低拷贝数型(CN-L)和高拷贝数型(CN-H)4种亚型,其中POLE超突变型预后最好,高拷贝数型(CN-H)较差,其他两类居中。并且,揭示了不同的分型具有不同的突变基因特征和通路活性特征。
基于本研究,今年TCGA子宫内膜癌分子分型首次被纳入NCCN指南,为临床医生推测预后、指导治疗提供了新方案。
本文转自肿瘤资讯(由“抗癌管家网站-康爱管家”转载分享)