
RNA 干扰(RNAi)技术凭借其靶标特异性强、环境友好等优势,已成为农业害虫防治领域的研究热点,2024 年 RNA 基农药被评为 “科学突破年度成果”,且 GreenLight Biosciences 的 RNA 基农药 Calantha 获美国 EPA 批准,标志着该领域的重大进展。然而,以双链 RNA(dsRNA)为基础的农药在实际应用中面临多重关键挑战,严重限制了其规模化推广。
在稳定性方面,dsRNA 易被环境核酸酶和昆虫肠道酶降解,尤其在具有刺吸式口器的半翅目害虫中,口服递送的 dsRNA 稳定性极差。在递送效率上,不同昆虫物种对 dsRNA 的摄取、加工和系统传播能力差异显著,且 dsRNA 跨细胞膜递送效率低,往往需要高剂量才能实现有效基因沉默,既增加成本又提升脱靶风险。在生产应用层面,传统 dsRNA 生产系统存在规模化难度大、成本高的问题,同时化学修饰或脂质等载体介导的递送策略可能引入毒性、降低活性或存在结构异质性等缺陷。SARNs
基于核酸纳米组装体在结构可塑性、自组装特性及抗核酸酶降解方面的优势,研究团队受 tRNA 等天然 RNA 稳定三维结构的启发,开发出工程化自组装 RNA 纳米结构(基于天然 RNA 基序(三向 / 五向支架、发夹环等),设计 4 种 SARNs 变体(SARN3w、以赤拟谷盗为模型,靶向 EcR 和将 Cy3 标记的 SARNs 通过水稻介导递送褐飞虱,观察植物体内转运(荧光成像)与害虫肠道分布,量化基因沉默效率与死亡率,评估田间应用可行性。构建 T7 启动子驱动的表达载体,在大肠杆菌 HT115 中实现自动诱导表达;通过 RNASwift 提取与冷冻干燥制备 SARNs 粉剂(粒径 3.87-7.01μm),优化生产工艺并进行成本核算。检测 SARNs 在不同温度(≤55℃)、UV 照射、pH 值及植物汁液中的稳定性,评估粉剂的储存与运输特性,完成实验室数据向田间应用的转化分析。利用 BLOCK-iT™ RNAi Designer 筛选 siRNA 序列,通过 Mfold 预测二级结构,SimRNAweb 模拟三维构象;采用 T7 RiboMAX™系统进行体外转录,经变性 PAGE 纯化后退火组装。采用将 SARNs 编码序列克隆至 pET23a 载体,转化大肠杆菌 HT115(DE3),通过氨苄青霉素筛选阳性克隆。采用 Talos F200C 冷冻电镜观察 SARN3w 的三维形态,使用 Hitachi Regulus 8100 扫描电镜分析冻干粉剂的形貌。通过 Agilent 1260 Infinity II HPLC 系统(DNAPac RP 柱)分析疏水性(保留时间);利用动态光散射(DLS)测定粉剂粒径分布(D10/D50/D90)。将 SARNs 与 dsRNA 分别暴露于不同 pH(4.0-10.0)、温度(25-55℃)、UV 照射及植物汁液中,通过 Native PAGE 检测降解情况。赤拟谷盗(GA-1 品系)饲养于含 5% 酵母粉的全麦粉培养基(28℃),褐飞虱饲养于水稻幼苗(28℃,14L:10D 光周期);采用显微注射(0.1-0.2μL / 个体)或植物介导递送(水稻浸泡 RNA 溶液)进行处理。每日记录幼虫死亡率,72 小时后通过 RT-qPCR 测定靶基因表达量;观察蜕皮障碍、体色改变等表型,通过统计分析(Log-rank 检验、单因素方差分析)比较组间差异。合成 Cy3 标记的 RNA,通过荧光显微镜(Nikon Eclipse 80i)观察其在植物茎 / 叶及昆虫肠道、脂肪体中的分布与滞留情况。采用含乳糖的自动诱导培养基培养工程菌,6 小时诱导后通过 RNASwift 法提取 RNA(无需酚 / 氯仿),经异丙醇沉淀纯化。将 RNA 浓缩液冷冻干燥制备粉剂,通过 IP-RP HPLC 验证纯度,测定重溶后浓度与活性保留率。基于 500mL 发酵体系,统计原料、耗材及人力成本,与传统 dsRNA 生产工艺进行对比分析。),旨在突破现有 RNAi 农药的技术瓶颈。
技术路线
SARNs 分子设计与表征:SARN5w、SARN3w-2x、SARN5wt),整合 3-5 种 siRNA duplex;通过冷冻电镜、IP-RP HPLC、RNase III 消化实验验证其结构完整性、疏水性及稳定性。
基因沉默效率验证:TcCht10基因,通过注射递送评估不同 SARNs 的基因敲降效率(RT-qPCR)与致死率;以褐飞虱为模型,设计 SARN3w-NlY-W-F 多基因靶向载体,验证表型改变与基因沉默的关联性。
植物介导递送验证:
规模化生产与制剂开发:
环境稳定性与田间适配性测试:
研究方法
SARNs 设计与合成:
基因表达分析:TRIzol法提取 RNA,通过 FastKing One-Step RT-qPCR Kit 合成 cDNA,使用 Hieff qPCR SYBR Green Master Mix 进行定量分析,以 RPS6(赤拟谷盗)和 RPS15(褐飞虱)为内参基因,采用 2⁻ᵃᵃᶜᵗ法计算相对表达量。
载体构建与菌株转化:
微观结构观察:
理化性质分析:
稳定性评估:
昆虫模型实验:
基因沉默与毒性评估:
体内转运追踪:
发酵与提取:
制剂制备:
成本核算:
研究结果
SARNs 的分子设计与理化特性验证结果
结构组装与表征:基于天然 RNA 基序的自下而上设计策略,成功构建 4 种 SARNs 变体(SARN3w、SARN5w、SARN3w-2x、SARN5wt),均能从单链 RNA 自折叠形成紧凑纳米结构。其中 SARN3w 直径 14 nm、SARN5w 直径 16 nm,处于 10-20 nm 的最优生物递送尺寸范围,经冷冻电镜证实呈三向连接的预期结构。IP-RP HPLC 分析显示,所有 SARNs 的保留时间均长于其线性化对照,其中 SARN3w 延迟 1.7 min,疏水性增强最为显著,为细胞摄取提供有利条件。
稳定性与降解特性:RNase III 消化实验表明,含突出端基序的 SARN3w 和 SARN5w 降解速率显著慢于 dsEcR(dsEcR 1 h 内完全降解,SARNs 20 h 内逐步释放 21 nt siRNA 片段);而去除突出端的 T4 连接变体(SARN3w-T4、SARN5w-T4)几乎不被降解,证实突出端基序介导酶促加工,发夹环结构延长 siRNA 稳定性的双重机制。

SARNs 在咀嚼式口器害虫中的基因沉默效果
以赤拟谷盗(Tribolium castaneum)为模型,靶向蜕皮激素受体(EcR)和几丁质酶 10(TcCht10)基因的实验结果显示:
高效基因敲降:注射 SARN3w 的 2 龄和 6 龄幼虫 EcR mRNA 表达量分别降低 94.9% 和 86.9%,显著高于 dsEcR 组的 51.9% 和 44.9%;SARN3w-TcCht10 对 TcCht10 的沉默效率达 96.0%,均表现出强效靶向抑制作用。
高致死率与典型表型:SARN3w 和 SARN5w 处理 7 天后,2 龄和 6 龄幼虫死亡率分别达 66.3% 和 63.8%,是 dsEcR 组的 1.6-2.8 倍;SARN3w-TcCht10 处理组死亡率达 95.0%。表型观察显示,幼虫出现生长停滞、体色加深、蜕皮障碍(蛹期旧表皮滞留)等典型发育异常,最终死亡。
结构对活性的影响:含突出端基序的 SARN3w、SARN5w 较无突出端的 SARN3w-2x、SARN5wt 起效更快(72 h 内生存率显著下降),且 SARN3w 因更高的结构灵活性(臂角可在 25°-165° 变化),在肠道和脂肪体中分布更广泛,荧光信号强度显著高于 dsRNA 组。

SARNs 在刺吸式口器害虫中的基因沉默效果
以褐飞虱(Nilaparvata lugens)为模型的实验结果表明:
多基因靶向验证:SARN3w-NlY-W-F 同时靶向 NlYellow、NlWhite、NlFoxO 基因,沉默效率分别达 97.5%、98.5% 和 57.3%,72 h 内出现体色黄化、眼色变白、长翅型分化等特征表型,证实各结构分支可独立发挥基因沉默作用。
EcR 靶向的防治效果:SARN3w-NlEcR 对 NlEcR 的沉默效率达 94.1%,是 dsNlEcR 组的 1.6 倍;7 天死亡率达 72.7%,较 dsRNA 组提升 50%,且出现明显蜕皮失败表型。
植物介导递送的有效性:Cy3 标记的 SARN3w-NlEcR 在水稻茎、叶中荧光信号更强且持续时间更长(叶片中 7 天达峰,茎中 14 天仍显著高于 dsRNA 组);褐飞虱取食后 48 h,仅 SARN 处理组在中肠检测到荧光信号,最终死亡率达 100%,较 dsRNA 组(66.7%)提升 50%。

SARNs 的规模化生产与制剂性能结果
高效发酵与提取:通过大肠杆菌 HT115(DE3)自动诱导表达,SARN3w 和 SARN5w 产量分别达 3029.52±216.96 ng/μL 和 2846.70±139.57 ng/μL,发酵液产量达 12.12±0.87 μg/mL 和 11.39±0.68 μg/mL,显著高于传统 dsRNA 的 4 μg/mL。RNASwift 提取法无需酚 / 氯仿,可快速获得高纯度产物,IP-RP HPLC 证实其与体外转录产物保留时间一致(SARN3w 10.9 min,SARN5w 12.7 min)。
制剂稳定性与活性保留:冻干粉剂粒径为 3.87-7.01 μm,重溶后浓度达 2453.91±175.84 ng/μL(SARN3w)和 2135.02±104.64 ng/μL(SARN5w),活性保留率超 80%。环境稳定性测试显示,SARN3w 在 pH10.0 条件下 12 h 仍可检测,而 dsRNA 快速降解;在植物汁液中 48 h 仍保持完整,dsRNA 24 h 即显著降解。
口服递送有效性:赤拟谷盗取食含 SARN 粉剂的饲料后,EcR 表达量降低 55.6%,最终生存率仅 43%;肠道解剖证实粉剂成功被摄入,证实口服递送的可行性。

成本与应用潜力分析结果
经济核算显示,SARN 浓缩液和粉剂的生产成本分别为 0.10 美元 /mg 和 0.13 美元 /mg,显著低于传统 dsRNA 生产工艺;siRNA 单位成本从 dsRNA 的 32.15 美元 /μmol 降至 SARN 平台的

讨论与分析
SARNs 的技术优势与作用机制
结构设计主导性能提升:SARNs 的核心优势源于模块化设计 —— 三向 / 五向支架提供结构稳定性,突出端基序启动 RNase III 快速消化以释放 siRNA,发夹环则保护剩余 siRNA 实现持续释放,形成 “即时起效 - 长效维持” 的作用模式。其中 SARN3w 因 14nm 粒径(处于 10-20nm 的最优递送范围)、高疏水性及 25°-165° 的臂角灵活性,表现出最高基因沉默效率(EcR 敲降率 94.9%),证实结构参数与生物活性的强关联性。
跨物种递送的关键因素:对于咀嚼式口器的赤拟谷盗,SARNs 通过肠道上皮细胞的 EPR 效应增强吸收;对于刺吸式口器的褐飞虱,其橡胶状变形能力使其能穿透植物维管系统并在昆虫中肠富集,解决了传统 dsRNA 在刺吸式害虫中递送低效的难题。
生产与应用的可行性分析
规模化生产的突破:通过大肠杆菌自动诱导表达,SARNs 产量达 11.39-12.12μg/mL 发酵液,较传统 dsRNA 生产提升近 3 倍;RNASwift 提取法缩短了纯化时间并降低降解风险,冻干粉剂重溶后活性保留率超 80%,满足田间应用对稳定性与量产的需求。
成本优势的核心来源:摒弃 IPTG 诱导改用乳糖自动诱导,减少毒性与成本;单链 RNA 自组装无需严格浓度配比,降低工艺复杂度;siRNA 装载量高(3-5 个 / 纳米结构),单位活性成本显著降低,为商业化推广奠定基础。

现存挑战与未来方向
待解决的关键问题:目前研究局限于实验室条件,田间复杂环境(微生物降解、雨水冲刷)对 SARNs 稳定性的影响尚未明确;对天敌等非靶标生物的长期影响需进一步评估;喷雾递送等田间施用方式的适配性有待优化。
潜在优化路径:可通过引入表面修饰(如生物黏合剂)提升叶面附着性,或开发土壤移动型纳米载体增强根系吸收;结合 AI 设计优化 SARNs 结构,进一步提升跨物种靶向性与抗降解能力;探索与生物防治剂、作物轮作等现有农业措施的协同应用模式。
多领域拓展潜力:SARNs 的可编程性使其可装载抗逆基因相关 siRNA 用于作物改良,其生物相容性与低毒性特性在肿瘤 RNA 疗法递送等生物医药领域也具有广阔应用前景,未来可通过跨学科合作挖掘更多功能价值。











